Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 ISU1YPL135W 498 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YER138CYER138C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YER160CYER160C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YJR027WYJR027W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YML039WYML039W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YML045WYML045W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YMR050CYMR050C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SNU56YDR240C 1479 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RGL1YPL066W 1440 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 PHO91YNR013C 2685 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SNF12YNR023W 1701 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YCR108CYCR108C 192 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ADK1YDR226W 669 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RPL29YFR032C-A 180 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RTS3YGR161C 792 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SYS1YJL004C 612 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YJL007CYJL007C 315 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SPC1YJR010C-A 285 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 MRPL44YMR225C 297 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YPL034WYPL034W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 NPR1YNL183C 2373 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP11P36026 GCD10YNL062C 1437 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 MSB1YOR188W 3414 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 TIF35YDR429C 825 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 LAG1YHL003C 1236 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YLR302CYLR302C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ARR2YPR200C 393 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YIL080WYIL080W 4722 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 DNL4YOR005C 2835 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 TOP2YNL088W 4287 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SCP160YJL080C 3669 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 MMS1YPR164W 4224 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SMC6YLR383W 3345 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ECM29YHL030W 5607 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 GCV2YMR189W 3105 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 PFF1YBR074W 2931 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 AAD16YFL057C 459 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YHR130CYHR130C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ARV1YLR242C 966 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YLR379WYLR379W 375 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 FPR1YNL135C 345 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 COQ10YOL008W 624 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ESC1YMR219W 4977 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 snR76snR76 109 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RTR2YDR066C 591 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RPS17BYDR447C 411 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 RGM1YMR182C 636 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YNL046WYNL046W 519 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ATX2YOR079C 942 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 TMN3YER113C 2121 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 ASM4YDL088C 1587 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP11P36026 SRO77YBL106C 3033 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 TSA2YDR453C 591 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YER189WYER189W 369 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 VAR1Q0140 1197 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YAP3YHL009C 993 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 FYV7YLR068W 456 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YPL080CYPL080C 327 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 STE11YLR362W 2154 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 ARP8YOR141C 2646 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 TPS2YDR074W 2691 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YIL166CYIL166C 1629 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 SMY2YBR172C 2223 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 AHC2YCR082W 387 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 GLC7YER133W 939 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 PBI2YNL015W 228 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 NSL1YPL233W 651 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 ACM1YPL267W 630 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 TOR1YJR066W 7413 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YKU80YMR106C 1890 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP11P36026 SGM1YJR134C 2124 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 SGS1YMR190C 4344 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 LSM2YBL026W 288 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 GPI17YDR434W 1605 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 KEL2YGR238C 2649 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 SDC25YLL016W 3147 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YBT1YLL048C 4986 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP11P36026 RPF1YHR088W 888 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP11P36026 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP11P36026 CMS1YLR003C 876 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP11P36026 CTK3YML112W 891 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP11P36026 RLI1YDR091C 1827 nt2.62□□□□□ -1.99
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