Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb1P09690 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb1P09690 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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