Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb3P09026 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms