Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc8E9PWG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms