Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf1B2RRD7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms