Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Knop1Q9Z2Q2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Knop1Q9Z2Q2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms