Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3glb1Q9JK48 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms