Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sh3bgrlQ9JJU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bgrlQ9JJU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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