Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm5Q9D806 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms