Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rassf9Q8K342 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rassf9Q8K342 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms