Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms