Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnot1Q6ZQ08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms