Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm10Q3UTQ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm10Q3UTQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms