Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 ROG1YGL144C 2058 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 ROM1YGR070W 3468 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PMR1YGL167C 2853 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 MDM1YML104C 3384 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YGL042CYGL042C 306 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YGR053CYGR053C 852 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 TCD1YHR003C 1290 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 DFG10YIL049W 762 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YOL134CYOL134C 390 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YPL197CYPL197C 414 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PUF6YDR496C 1971 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 FLO5YHR211W 3228 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 DSE4YNR067C 3354 nt2.92□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 KHA1YJL094C 2622 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 HOP1YIL072W 1818 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YRR1YOR162C 2433 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 VAC8YEL013W 1737 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 URB2YJR041C 3525 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 AI2Q0055 2565 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDR061WYDR061W 1620 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDR442WYDR442W 393 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 NBL1YHR199C-A 222 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YJL169WYJL169W 369 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YJR079WYJR079W 330 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 RPL40BYKR094C 387 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PDR17YNL264C 1053 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YOL150CYOL150C 312 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YBR032WYBR032W 303 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YPL225WYPL225W 441 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 VID24YBR105C 1089 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 VHR2YER064C 1518 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 MAL33YBR297W 1407 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 TLC1TLC1 1301 nt2.91□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 MSH4YFL003C 2637 nt2.9□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YKL222CYKL222C 2118 nt2.9□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YER181CYER181C 324 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YHL005CYHL005C 393 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 BSC3YLR465C 309 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YNL043CYNL043C 321 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RPL16BYNL069C 597 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SFM1YOR021C 642 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RRD2YPL152W 1077 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 NET1YJL076W 3570 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 MSL5YLR116W 1431 nt2.9□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RTR2YDR066C 591 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YGR242WYGR242W 309 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 OTU2YHL013C 924 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 TEN1YLR010C 483 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RPL6AYML073C 531 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 PDS5YMR076C 3834 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 FMP23YBR047W 528 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SEN54YPL083C 1404 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 MRPL40YPL173W 894 nt2.89□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ITC1YGL133W 3795 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YCR090CYCR090C 549 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RPL27BYDR471W 411 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 AST2YER101C 1293 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 DLS1YJL065C 504 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YLR434CYLR434C 384 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 TIM12YBR091C 330 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 GPI17YDR434W 1605 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YJR098CYJR098C 1971 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 STN1YDR082W 1485 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YME2YMR302C 2553 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 FLO1YAR050W 4614 nt2.88□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ILS1YBL076C 3219 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 UBP14YBR058C 2346 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SNQ2YDR011W 4506 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 MRH1YDR033W 963 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 BMH2YDR099W 822 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YPS5YGL259W 498 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YLR012CYLR012C 300 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 APC9YLR102C 798 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RRT16YNL105W 429 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SWM2YNR004W 441 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ARR2YPR200C 393 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YDR338CYDR338C 2088 nt2.87□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 PSY2YNL201C 2577 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 VEL1YGL258W 621 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RMP1YLR145W 606 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 CGI121YML036W 546 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SMA2YML066C 1110 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YOR385WYOR385W 873 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YBR209WYBR209W 318 nt2.86□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 CEP3YMR168C 1827 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 CDC50YCR094W 1176 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 HMF1YER057C 390 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RPL23BYER117W 414 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 SRL3YKR091W 741 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YLR302CYLR302C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ATG13YPR185W 2217 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YIL169CYIL169C 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 DOA4YDR069C 2781 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ICR1ICR1 3199 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms