Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sdr16c6Q05A13 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms