Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms