Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RptnP97347 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RptnP97347 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RptnP97347 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RptnP97347 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms