Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms