Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 SPR3YGR059W 1539 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK2P53599 YKL162CYKL162C 1209 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK2P53599 YMR320WYMR320W 306 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK2P53599 NCL1YBL024W 2055 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK2P53599 RPL16AYIL133C 600 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK2P53599 NOP15YNL110C 663 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK2P53599 BEM3YPL115C 3387 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK2P53599 TRM82YDR165W 1335 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK2P53599 WAR1YML076C 2835 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK2P53599 YBR134WYBR134W 402 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK2P53599 RUD3YOR216C 1455 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK2P53599 COG8YML071C 1824 nt1.09□□□□□ -2.23
SSK2P53599 MNL2YLR057W 2550 nt1.09□□□□□ -2.24
SSK2P53599 SPB4YFL002C 1821 nt1.09□□□□□ -2.24
SSK2P53599 SPC29YPL124W 762 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YGR117CYGR117C 1431 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK2P53599 DBF20YPR111W 1695 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK2P53599 MCR1YKL150W 909 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK2P53599 STB4YMR019W 2850 nt1.07□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YGR050CYGR050C 357 nt1.07□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YLR140WYLR140W 327 nt1.07□□□□□ -2.24
SSK2P53599 THI80YOR143C 960 nt1.07□□□□□ -2.24
SSK2P53599 STN1YDR082W 1485 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK2P53599 NDJ1YOL104C 1059 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK2P53599 APL1YJR005W 2103 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK2P53599 MGA1YGR249W 1371 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YOR292CYOR292C 930 nt1.05□□□□□ -2.24
SSK2P53599 MAL33YBR297W 1407 nt1.05□□□□□ -2.24
SSK2P53599 PPN1YDR452W 2025 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK2P53599 RSA3YLR221C 663 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK2P53599 COS12YGL263W 1143 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK2P53599 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK2P53599 ITT1YML068W 1395 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK2P53599 RTT101YJL047C 2529 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 TIM11YDR322C-A 291 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 MPO1YGL010W 525 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 RSR1YGR152C 819 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YLR076CYLR076C 423 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 VMA6YLR447C 1038 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 RKR1YMR247C 4689 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK2P53599 AIM6YDL237W 1173 nt1.01□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YBR138CYBR138C 1575 nt1.01□□□□□ -2.25
SSK2P53599 NPL6YMR091C 1308 nt1□□□□□ -2.25
SSK2P53599 ALG11YNL048W 1647 nt1□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YOR082CYOR082C 342 nt1□□□□□ -2.25
SSK2P53599 MPS1YDL028C 2295 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 IFH1YLR223C 3258 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 ARP10YDR106W 855 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YIL058WYIL058W 285 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK2P53599 AI2Q0055 2565 nt0.98□□□□□ -2.25
SSK2P53599 RPS17BYDR447C 411 nt0.98□□□□□ -2.25
SSK2P53599 CMR3YPR013C 954 nt0.98□□□□□ -2.25
SSK2P53599 SRP1YNL189W 1629 nt0.97□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YER066C-AYER066C-A 501 nt0.97□□□□□ -2.25
SSK2P53599 AIM14YGL160W 1713 nt0.97□□□□□ -2.25
SSK2P53599 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.96□□□□□ -2.26
SSK2P53599 AIM11YER093C-A 414 nt0.96□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YGL193CYGL193C 312 nt0.96□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YJL169WYJL169W 369 nt0.96□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YML084WYML084W 309 nt0.96□□□□□ -2.26
SSK2P53599 UBX4YMR067C 1251 nt0.95□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YNL043CYNL043C 321 nt0.95□□□□□ -2.26
SSK2P53599 AAH1YNL141W 1044 nt0.95□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YBR238CYBR238C 2196 nt0.94□□□□□ -2.26
SSK2P53599 SMT3YDR510W 306 nt0.94□□□□□ -2.26
SSK2P53599 RPA12YJR063W 378 nt0.94□□□□□ -2.26
SSK2P53599 FIP1YJR093C 984 nt0.94□□□□□ -2.26
SSK2P53599 EBP2YKL172W 1284 nt0.94□□□□□ -2.26
SSK2P53599 BUD30YDL151C 582 nt0.93□□□□□ -2.26
SSK2P53599 HRT3YLR097C 1035 nt0.93□□□□□ -2.26
SSK2P53599 HTA2YBL003C 399 nt0.93□□□□□ -2.26
SSK2P53599 RPS18BYML026C 441 nt0.93□□□□□ -2.26
SSK2P53599 PUF4YGL014W 2667 nt0.93□□□□□ -2.26
SSK2P53599 YGL242CYGL242C 546 nt0.92□□□□□ -2.26
SSK2P53599 NBL1YHR199C-A 222 nt0.92□□□□□ -2.26
SSK2P53599 SUI2YJR007W 915 nt0.92□□□□□ -2.26
SSK2P53599 SEC8YPR055W 3198 nt0.92□□□□□ -2.26
SSK2P53599 AVT5YBL089W 1380 nt0.92□□□□□ -2.26
SSK2P53599 PET123YOR158W 957 nt0.91□□□□□ -2.26
SSK2P53599 HIR3YJR140C 4947 nt0.91□□□□□ -2.26
SSK2P53599 TGL2YDR058C 981 nt0.91□□□□□ -2.26
SSK2P53599 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 RPS29BYDL061C 171 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 SEC4YFL005W 648 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 YGR290WYGR290W 444 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 FCF2YLR051C 654 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 SWI6YLR182W 2412 nt0.9□□□□□ -2.27
SSK2P53599 ECM18YDR125C 1362 nt0.89□□□□□ -2.27
SSK2P53599 PRP39YML046W 1890 nt0.89□□□□□ -2.27
SSK2P53599 YDL062WYDL062W 426 nt0.89□□□□□ -2.27
SSK2P53599 SRL1YOR247W 633 nt0.89□□□□□ -2.27
SSK2P53599 SEC63YOR254C 1992 nt0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.7 ms