Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chil3O35744 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms