Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna3O08545 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms