Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms