Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc1Q9QZF2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Gpc1Q9QZF2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gpc1Q9QZF2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gpc1Q9QZF2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gpc1Q9QZF2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc1Q9QZF2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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