Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col5a3Q9JLI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms