Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3glb1Q9JK48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms