Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms