Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP30Q70CQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP30Q70CQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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