Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms