Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2surpQ6NV83 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms