Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YER138CYER138C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YER160CYER160C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YJR027WYJR027W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YML039WYML039W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YML045WYML045W 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YMR050CYMR050C 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 CDC20YGL116W 1833 nt2.45□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YCL020WYCL020W 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 MSB1YOR188W 3414 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 ESL1YIL151C 3357 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 BIT61YJL058C 1632 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 PBP4YDL053C 558 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 ATP6Q0085 780 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 RPF1YHR088W 888 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YJR141WYJR141W 1044 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 DYN3YMR299C 939 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 KTI11YBL071W-A 249 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 MIX23YBL107C 591 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 RPC40YPR110C 1008 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SUS1YBR111W-A 291 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YLR278CYLR278C 4026 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 DBP7YKR024C 2229 nt2.44□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 JSN1YJR091C 3276 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 NFT1YKR103W 3657 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 snR9snR9 187 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YGR290WYGR290W 444 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YLR379WYLR379W 375 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 AIM36YMR157C 768 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 BNA4YBL098W 1383 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 ESL2YKR096W 3588 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 JJJ2YJL162C 1752 nt2.43□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 PRP8YHR165C 7242 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 UBP1YDL122W 2430 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 RVS161YCR009C 798 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YCR013CYCR013C 648 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 snR84snR84 550 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 NCB2YDR397C 441 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 CAJ1YER048C 1176 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SDL1YIL167W 633 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 BET4YJL031C 984 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YJR157WYJR157W 363 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 MRPL40YPL173W 894 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 CSM4YPL200W 471 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YPR203WYPR203W 309 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 FIR1YER032W 2631 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 NUM1YDR150W 8247 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 VHR1YIL056W 1923 nt2.42□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 DBF20YPR111W 1695 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SMC6YLR383W 3345 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 FUS2YMR232W 2034 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 ARK1YNL020C 1917 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SLD5YDR489W 885 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 MTC7YEL033W 420 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 MVB12YGR206W 306 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SRP21YKL122C 504 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 UBX4YMR067C 1251 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 SWS2YNL081C 432 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 BRE5YNR051C 1548 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 AI2Q0055 2565 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 LST4YKL176C 2487 nt2.41□□□□□ -2.02
YPQ1Q12010 YDR262WYDR262W 819 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 RPL17BYJL177W 555 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 CPR7YJR032W 1182 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 RPL16BYNL069C 597 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YCL023CYCL023C 348 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YIL080WYIL080W 4722 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 ASI3YNL008C 2031 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 ANR2YKL047W 1551 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 SSQ1YLR369W 1974 nt2.4□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 DUG2YBR281C 2637 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 ATG11YPR049C 3537 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YDL187CYDL187C 330 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YDR115WYDR115W 318 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 NTF2YER009W 378 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YFL019CYFL019C 354 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 THG1YGR024C 714 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 BET3YKR068C 582 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 PET123YOR158W 957 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 KEL2YGR238C 2649 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 ARP8YOR141C 2646 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 GCD10YNL062C 1437 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 MAL33YBR297W 1407 nt2.39□□□□□ -2.03
YPQ1Q12010 NPR3YHL023C 3441 nt2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.8 ms