Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf9Q07105 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms