Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 LAG1YHL003C 1236 nt3.91□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 RPL40BYKR094C 387 nt3.91□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 YLR230WYLR230W 306 nt3.91□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 ERP4YOR016C 624 nt3.91□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 YLR001CYLR001C 2589 nt3.91□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 RSC1YGR056W 2787 nt3.9□□□□□ -1.78
GDE1Q02979 VFA1YER128W 612 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YGL165CYGL165C 579 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YOR199WYOR199W 330 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 URA2YJL130C 6645 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 VBA4YDR119W 2307 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RNH70YGR276C 1662 nt3.9□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 CHA4YLR098C 1947 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 TAF1YGR274C 3201 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YOL150CYOL150C 312 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 ARK1YNL020C 1917 nt3.89□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 SIZ1YDR409W 2715 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 MNT3YIL014W 1893 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 GNT1YOR320C 1476 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 MSH2YOL090W 2895 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RPL22AYLR061W 366 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RFC3YNL290W 1023 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 CDC33YOL139C 642 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 TSC3YBR058C-A 243 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 XRN1YGL173C 4587 nt3.88□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 SDH7YDR511W 402 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 SIP18YMR175W 240 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 IMP4YNL075W 873 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RPB11YOL005C 363 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YPL039WYPL039W 951 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 BNI4YNL233W 2679 nt3.87□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 STN1YDR082W 1485 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 ALA1YOR335C 2877 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 MDN1YLR106C 14733 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 ATP22YDR350C 2055 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 CWC22YGR278W 1734 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 KIN82YCR091W 2163 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 BFR1YOR198C 1413 nt3.86□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 MYO5YMR109W 3660 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RPS23AYGR118W 438 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YIL012WYIL012W 342 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RPS24BYIL069C 408 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 LSM8YJR022W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YJR079WYJR079W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 LSM2YBL026W 288 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YMR141CYMR141C 309 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 ZEO1YOL109W 342 nt3.85□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YDR193WYDR193W 399 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 RNR4YGR180C 1038 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YAR068WYAR068W 486 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 YLR434CYLR434C 384 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 HEM4YOR278W 828 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 DGK1YOR311C 873 nt3.84□□□□□ -1.79
GDE1Q02979 ROY1YMR258C 1662 nt3.84□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 NMA111YNL123W 2994 nt3.84□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 VPS3YDR495C 3036 nt3.84□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RAD6YGL058W 519 nt3.83□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.83□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.83□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 MSL5YLR116W 1431 nt3.83□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 SHQ1YIL104C 1524 nt3.83□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 SPA2YLL021W 4401 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 AKR1YDR264C 2295 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 TIF35YDR429C 825 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RRT13YER066W 558 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RPS28BYLR264W 204 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 ISU1YPL135W 498 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 SLM6YBR266C 453 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PFK26YIL107C 2484 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 TFC1YBR123C 1950 nt3.82□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 MDM32YOR147W 1869 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 ERG28YER044C 447 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YGR035CYGR035C 351 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YKL136WYKL136W 399 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YAR070CYAR070C 300 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RPS1AYLR441C 768 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 MRPL50YNR022C 420 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YOR121CYOR121C 306 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 snR13snR13 124 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YOR385WYOR385W 873 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 TIM12YBR091C 330 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 NUP60YAR002W 1620 nt3.81□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 VHR2YER064C 1518 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 ATP17YDR377W 306 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PAU23YLR037C 375 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RPL37AYLR185W 267 nt3.8□□□□□ -1.8
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