Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmklr1P97468 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms