Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YBR071W	YBR071W	636 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YME2	YMR302C	2553 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	PBS2	YJL128C	2007 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	ATP22	YDR350C	2055 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	ERG28	YER044C	447 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	PRS3	YHL011C	963 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	GIC1	YHR061C	945 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.66	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.65	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	AFR1	YDR085C	1863 nt		2.65	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	snR84	snR84	550 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	IRC2	YDR112W	309 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	snR191	snR191	274 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	SEN54	YPL083C	1404 nt		2.65	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	BET4	YJL031C	984 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YLR202C	YLR202C	327 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RRT16	YNL105W	429 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	HEM4	YOR278W	828 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	VID24	YBR105C	1089 nt		2.64	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RPL23B	YER117W	414 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YPL068C	YPL068C	882 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.63	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	VPS74	YDR372C	1038 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RSR1	YGR152C	819 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	IST3	YIR005W	447 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	MRP49	YKL167C	414 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	SDO1	YLR022C	753 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	AIM36	YMR157C	768 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	ALY1	YKR021W	2748 nt		2.62	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	ERP6	YGL002W	651 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	MRM2	YGL136C	963 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	OTU2	YHL013C	924 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	APQ13	YJL075C	417 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	ILM1	YJR118C	612 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YOR331C	YOR331C	558 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	JID1	YPR061C	906 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.61	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	BNI1	YNL271C	5862 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	DUG2	YBR281C	2637 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	APC11	YDL008W	498 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	TIM11	YDR322C-A	291 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YDR509W	YDR509W	348 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	CHZ1	YER030W	462 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RPS26B	YER131W	360 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YGL042C	YGL042C	306 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YIR020C	YIR020C	303 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	APC9	YLR102C	798 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	ILV5	YLR355C	1188 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RIM9	YMR063W	720 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	UBX4	YMR067C	1251 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	VPS20	YMR077C	666 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RIO2	YNL207W	1278 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YOR364W	YOR364W	369 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YEL1	YBL060W	2064 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.6	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	TRZ1	YKR079C	2517 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YIL029C	YIL029C	429 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	JIP3	YLR331C	378 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	RPS29A	YLR388W	171 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	YMR144W	YMR144W	1029 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	TRS20	YBR254C	528 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.59	□□□□□ -1.99
DSL1	P53847	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	DAL5	YJR152W	1632 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YDL009C	YDL009C	324 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	HMF1	YER057C	390 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YNL179C	YNL179C	438 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		2.58	□□□□□ -2
DSL1	P53847	TOF1	YNL273W	3717 nt		2.58	□□□□□ -2

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