Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YET1YKL065C 621 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 YKL066WYKL066W 444 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 SCY1YGL083W 2415 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 TRS130YMR218C 3309 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 URK1YNR012W 1506 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC28P40509 RPS26BYER131W 360 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC28P40509 HSC82YMR186W 2118 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YEF3YLR249W 3135 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC28P40509 SLN1YIL147C 3663 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC28P40509 RGL1YPL066W 1440 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 TIF35YDR429C 825 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 PRP38YGR075C 729 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YGR115CYGR115C 780 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 PEX18YHR160C 852 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YOR050CYOR050C 348 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 VID24YBR105C 1089 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 BNR1YIL159W 4128 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 PDR3YBL005W 2931 nt2.51□□□□□ -2.01
SEC28P40509 EDS1YBR033W 2760 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 INP53YOR109W 3324 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 DAD1YDR016C 285 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 ATP3YBR039W 936 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YPL276WYPL276W 438 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 POP7YBR167C 423 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 VAC8YEL013W 1737 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 TRA1YHR099W 11235 nt2.5□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 PRE1YER012W 597 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 MST27YGL051W 705 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YGL109WYGL109W 324 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 TWF1YGR080W 999 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 SYS1YJL004C 612 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YJL086CYJL086C 369 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YOR055WYOR055W 435 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 ADF1YCL058W-A 342 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 PRP6YBR055C 2700 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 Q0255Q0255 1419 nt2.49□□□□□ -2.01
SEC28P40509 KAR9YPL269W 1935 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 SEC16YPL085W 6588 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 SMC6YLR383W 3345 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YNL046WYNL046W 519 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 MIX23YBL107C 591 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YBR287WYBR287W 1284 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 CBF2YGR140W 2871 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 NUP100YKL068W 2880 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YPR089WYPR089W 2667 nt2.48□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YEL043WYEL043W 2871 nt2.47□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YRB1YDR002W 606 nt2.47□□□□□ -2.01
SEC28P40509 ACB1YGR037C 264 nt2.47□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YMR320WYMR320W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
SEC28P40509 YRR1YOR162C 2433 nt2.46□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YCR108CYCR108C 192 nt2.46□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PET191YJR034W 327 nt2.46□□□□□ -2.02
SEC28P40509 EMC6YLL014W 327 nt2.46□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YMR187CYMR187C 1296 nt2.46□□□□□ -2.02
SEC28P40509 KSP1YHR082C 3090 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 MRP10YDL045W-A 288 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YGR242WYGR242W 309 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 CAP1YKL007W 807 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 ARR2YPR200C 393 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YBR197CYBR197C 654 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 IRA2YOL081W 9240 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PSO2YMR137C 1986 nt2.45□□□□□ -2.02
SEC28P40509 KEL2YGR238C 2649 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SCD5YOR329C 2619 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PDR11YIL013C 4236 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PHO91YNR013C 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SWR1YDR334W 4545 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PBP4YDL053C 558 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 MRM2YGL136C 963 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 BET3YKR068C 582 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 RPL25YOL127W 429 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YOR169CYOR169C 465 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SNF12YNR023W 1701 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 GDI1YER136W 1356 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 NEW1YPL226W 3591 nt2.44□□□□□ -2.02
SEC28P40509 VPS16YPL045W 2397 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SVL3YPL032C 2478 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YFH1YDL120W 525 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 snR83snR83 306 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 TIM9YEL020W-A 264 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 COG2YGR120C 789 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YIP1YGR172C 747 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YIL082WYIL082W 873 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 AIM32YML050W 936 nt2.43□□□□□ -2.02
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