Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRAP19793 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRAP19793 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRAP19793 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRAP19793 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRAP19793 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRAP19793 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRAP19793 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRAP19793 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms