Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms