Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a3A2ACT7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms