Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms