Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col5a3Q9JLI2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms