Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3glb1Q9JK48 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms