Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms