Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ms4a4bQ9ES61 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4bQ9ES61 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4bQ9ES61 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4bQ9ES61 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a4bQ9ES61 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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