Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc46a3Q9DC26 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc46a3Q9DC26 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms