Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2Q8CDM1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms