Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms