Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snapc4Q8BP86 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snapc4Q8BP86 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms