Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot1Q6ZQ08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms