Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms