Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mre11Q61216 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mre11Q61216 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mre11Q61216 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mre11Q61216 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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